آموزش ژنتیک مولکولی

ساختار DNA

نوکلئوتیدهای مونومر DNA

پلی نوکلئوتیدها

اتصال نوکلئوتیدها توسط پیوندهای فسفودی استر (Phosphodiester Bond)

پایانه‌های شیمیایی متمایز پلی نوکلئوتیدها

طول و توالی پلی نوکلئوتیدها

مارپیچ دو‌گانه

نسبت بازهای چارگف

تجزیه DNA توسط پراش اشعه X

خصوصیات مارپیچ دوگانه DNA

اشکال متفاوت DNA

عوامل پایدارکننده DNA

DNA فراپیچیده (سوپرکویل)

توپوایزومرازها (Topoisomerase)

بازهای تغییریافته DNA

پلی نوکلئوتید RNA

نوکلئوتیدهای تشکیل‌دهنده RNA

انواع مختلف RNA در سلول

تفاوت شیمیایی RNA و DNA

ژن‌ها قطعاتی از DNA هستند

سازمان‌دهی ژن در DNA

ژن‌های خوشه‌ای

اپرون‌ها

خانواده‌های چند‌ژنی

ژن‌های غیر فعال

ژن‌های منقطع

تظاهر ژن

اصل قضیه مرکزی

رونویسی

ترجمه

نقش پروتئین‌ها

کروموزوم (Chromosome)

انواع کروموزم‌ها از نظر محل سانترومر

کروماتین (Chromatin)

هیستون (Histone)

اثر متقابل هیستون با هیستون در نوکلئوزوم

نوکلئوزوم (nucleosome)

سلنوئید (solenoid)

تا خوردن DNA

توزیع نوکلئوزوم‌‌ها

بسته‌‌بندی کروموزوم‌ها

تغییر مدل کروماتین (chromatin remodeling)

تغییرات شیمیایی هیستون‌ها

استیلاسیون هیستون‌ها

متیلاسیون هیستون‌ها

فسفریلاسیون هیستون‌ها

تاثیر تغییر شیمیایی هیستون‌ها در ساختار کروماتین و بیان ژن

متیلاسیون DNA

غیر فعال‌سازی کروموزوم x با ایجاد هتروکروماتین

قابل توارث بودن تغییر ساختار کروماتین

کروموزوم‌های پلی‌تن (polytene)

کروموزوم‌های لامپ براش (lumpbrush)

الگوی کلی همانندسازی

آزمایش مزلسون و استال

همانندسازی در پروکاریوت‌ها

نقش پروتئین‌ها در همانندسازی

پروتئین DnaA

پروتئین DnaB

پروتئین DnaC

پروتئین‌های SSB

پرایماز

پروتئین‌های n", n′, n و i

پروتئین Rep

DNA پلیمراز پروکاریوتی

DNA پلیمراز I

DNA پلیمراز II

DNA پلیمراز III

مراحل همانندسازی DNA در پروکاریوت‌ها

مرحله آغاز

مرحله طویل شدن

اصلاح DNA

مرحله خاتمه

همانندسازی در یوکاریوت‌ها

DNA پلیمراز یوکاریوتی

همانندسازی در میتوکندری

همانندسازی به روش حلقه چرخان

همانندسازی در ویروس‌های DNAدار

همانندسازی در باکتریوفاژ ɸX174

همانندسازی در باکتریوفاژ ʎ

همانندسازی در فازهای T

ساختمان RNA

انواع RNA

RNA پیامبر (mRNA)

RNA ریبوزومی (rRNA)

RNA حامل (tRNA)

hnRNA (heterogeneous nuclear RNA)

(Small nuclear RNA) SnRNA

(Small cytoplasmic RNA) ScRNA

آنزیم RNA پلیمراز

آنزیم RNA پلیمراز پروکاریوتی

آنزیم RNA پلیمراز یوکاریوتی

تغییر و پردازش mRNA (mRNA Splicing)

تغییر و پردازش tRNA (tRNA Splicing)

رونویسی در پروکاریوت‌ها

مرحله آغاز رونویسی

مرحله تداوم رونویسی

مرحله خاتمه رونویسی

خاتمه ساده

خاتمه وابسته به فاکتور Rho (Rho Termination)

رونویسی در یوکاریوت‌ها

آغاز رونویسی توسط RNA پلیمراز II

آغاز رونویسی توسط RNA پلیمراز I

آغاز رونویسی توسط RNA پلیمراز III

پایان رونویسی

RNA مونوسیسترونی و پلی سیسترونی

آنتی بیوتیک‌های ممانعت‌کننده از رونویسی

تکامل RNA (RNA Processing)

نقش آنزیم‌ها در تکامل RNA پروکاریوت

تکامل RNA در یوکاریوت

تکامل rRNA

تکامل tRNA

تکامل mRNA در یوکاریوت

کلاهک‌گذاری در انتهای ′5

دم پلی A در انتهای 3′

پیرایش اینترون‌ (Intron Splicing)

اینترون GT-AG

اینترون خودپیرایش

اینترون AT-AC

اینترون گروه II

اینترون tRNA

اهمیت اینترون

ویرایش RNA (RNA Editing)

اسیدهای آمینه

سطوح مختلف ساختمان پروتئین

توالی اسید آمینه کلید ساختار و کنش پروتئین

مطالعه ساختمان پروتئین

رمز ژنتیکی

ویژگی‌های رمز ژنتیکی

اصول مولکولی کدون‌های مترادف

نقش tRNA در ترجمه

تشکیل آمینواسیل tRNA

تشخیص کدون

مراحل ترجمه در پروکاریوت‌ها

مرحله آغاز ترجمه

تداوم زنجیره پلی‌پپتیدی

مرحله پایان ترجمه

ترجمه در یوکاریوت‌ها

مقایسه دستگاه ترجمه در پرو و یوکاریوت‌ها

تغییرات بعد ترجمه

پروتئین‌سازی در میتوکندری و کلروپلاست

آنتی بیوتیک‌های موثر در پروتئین‌سازی

انتقال پروتئین‌ها از غشا

جهش (Mutation)

انواع مختلف جهش

جهش در سطح DNA

جهش در سطح ژن

جهش در سطح موجود زنده

برگشت اثر یک جهش

عوامل جهش‌زا

ساخت پروتئین بدون mRNA

تنظیم بیان ژن

راهبردهای ممکن برای کنترل تظاهر ژن

کنترل تظاهر ژن در باکتری‌ها

بیان ژن توسط فاکتور δ

کنترل رونویسی توسط رپرسور و فعال‌کننده

تنظیم اپرون لاکتوز

تنظیم اپرون تریپتوفان

تنظیم اپرون آرابینوز

تنظیم تظاهر ژن در یوکاریوت‌ها

تنظیم بیان ژن توسط افزایش‌دهنده‌ها (Enhancer)

تنظیم بیان ژن توسط هورمون‌ها

تنظیم بیان ژن توسط فاکتور T (Transcription Factor)

القا و فرونشاندن آنزیمی

پیرایش دگرواره (Alternative Splicing)

پایداری mRNA و بیان ژن

تکثیر بعضی ژن‌ها در طی تکامل

غیرفعال شدن یکی از کروموزوم‌های X در پستانداران ماده

تنظیم بیان ژن در هنگام ترجمه

تنظیم بیان ژن متالوتیونئین در انسان

تنظیم بیان ژن توسط miRNAs (Micro RNAs)

ترمیم DNA (DNA Repair)

ترمیم مستقیم (Direct Repair)

ترمیم خارج‌سازی بازی (Base Excision Repair)

ترمیم خارج‌سازی نوکلئوتیدی (Nucleotide Excision Repair)

ترمیم جفت‌شدگی ناجور (Mismatch Repair)

نوترکیبی (Recombination)

نوترکیبی همتا (Homologous Recombination)

نوترکیبی موضعی (Site Specific Recombination)

نوترکیبی ناروا (Illegitimate Recombination)

نقش نوترکیبی در ژنتیک

ترسیم ژنی در باکتری

اهمیت ترسیم نقشه ژنی در باکتری

ترسیم نقشه ژنی به وسیله هماوری (conjugation)

ترسیم نقشه ژنی به وسیله ترارسانی (transduction)

ترسیم نقشه ژنی به وسیله تراریختی (transformation)

مزایای نسبی سه روش

حامل‌های کلون برای مخمر و سایر قارچ‌ها

پلاسمید µ2 مخمر

پلاسمیدهای اپیزومی مخمر (Yeast Episomal Plasmids) YEP

پلاسمیدهای مخمری تلفیق شونده (Yeast Integrating plasmids) YIps

پلاسمیدهای تکثیری مخمر (Yeast Replicative plasmids) YRps

کروموزوم مصنوعی مخمر (YAC (Yeast Artificial Chromosomes

حامل‌های کلون برای گیاهان عالی

پلاسمیدهای طبیعی اگروباکتریوم (Agrobacterium Tumefaciens)

پلاسمید القا‌کننده تومور یا پلاسمید Ti

کاربرد مهندسی ژنتيک

جداسازی و خالص‌سازی DNA و RNA از سلول‌

اندازه‌گیری غلظت DNA

خالص‌سازی DNA

روش‌های آشکارسازی اسیدهای نوکلئیک

آنزیم‌های مورد استفاده برای دستکاری DNA

نوکلئازها

لیگازها

پلیمرازها

تغییردهنده‌ها

توپوایزومرازها

قرار دادن انتهای چسبنده روی مولکول‌های با انتهای تراز

اتصال‌دهنده‌ها (Linker)

سازگارکننده‌ها (Adaptor)

افزودن هموپلیمر

آنزیم توپوایزومراز

انواع حامل‌های کلون برای E.coli

پلاسمیدها (Plasmid)

ناقل‌های باکتریوفاژی (Bacteriophage Vector)

کاسمیدها (Casmid)

کروموزوم مصنوعی باکتری (Bacterial Artificial Chromosome)

Agrobacterium Rhizogenes

محدودیت کلون‌سازی با پلاسمیدهای اگروباکتریوم

کلون‌سازی ژن‌ها در گیاهان با انتقال مستقیم ژن

کلون‌سازی ژن‌ها در گیاهان توسط ویروس‌های گیاهی

کالیموویروس (Caulimovirus)

جمینی‌ویروس (Geminivirus)

حامل‌های کلون برای پستانداران

کلون‌سازی ژن با حامل ویروسی

ویروس سیمیان ۴۰ (SV40)

آدنوویروس

پاپیلوماویروس

ویروس همراه آدنو (AAV)

رتروویروس

کلون سازی ژن بدون حامل

ریزتزریقی

سلول بنیادی جنینی (Embryonic Stem Cell)

شیمر (Chimera)

روش‌های انتقال ژن

اگروباکتریوم

بمباران ذره‌ای

ریزتزریقی (Microinjection)

لیپوزوم‌ها

الکتروپوریشن

جذب مستقیم DNA

درشت‌تزریقی (Macroinjection)

پلی‌کاتیون‌ها

ژنومیکس (Genomics)

کاریوتایپ (Karyotype)

روش‌های باندينگ (Banding)

(Fluorescence In Situ Hybridization) FISH

Multifluor FISH (Spectral Karyotyping)

ترانسکريپتوميکس (Transcriptomics)

آنالیز متوالی بیان ژن (SAGE)

آنالیز تراشه یا ریزآرایه (Microarray)

تراشه‌های DNA (DNA Chips)

پروتئومیکس (Proteomics)

الکتروفورز دو‌بعدی روی ژل پلی آکريل آميد (2D-PAGE)

روش طيف‌سنجی جرمی يا MS (Mass Specterometry)

بیوانفورماتیک (Bioinformatics)

منشا انسان امروزی

ساختار ژنوم انسان

خانواده‌های چندژنی در انسان

آثار باقیمانده ژنی (Gene Relics)

DNA فراژنی (خارج ژنی)

DNA تکراری پراکنده (dispersive repetitive DNA)

(Short Interspersed Nuclear Element) SINE

(Long Interspersed Nuclear Element) LINE

(Human Endogenous Retroviruses) HERV

DNA تکراری خوشه‌ای (Clustered Repetitive DNA)

ماهواره‌ها (Satellites)

ماهوارک‌ها (Minisatellites)

ریز‌ماهواره‌ها (Microsatellites)

شباهت ژنوم انسان به میمون‌های بزرگ

چند شکلی در ژنوم انسان

پروژه ژنوم انسان